Στις 2 Δεκεμβρίου 2004, 9 χρόνια μετά τη λήξη του πολέμου, η Ευρωπαϊκή Ένωση (ΕΕ) ξεκίνησε τη στρατιωτική επιχείρηση ALTHEA στη Βοσνία-Ερζεγοβίνη. Αυτό ακολούθησε την απόφαση του ΝΑΤΟ να παραδώσει τη δική του ειρηνευτική αποστολή που διατηρούσε την ασφάλεια στην περιοχή από τη λήξη του πολέμου. Η ΕΕ ανέπτυξε μια ισχυρή στρατιωτική δύναμη (EUFOR) για να διασφαλίσει τη συνεχή συμμόρφωση με τη Συμφωνία του Ντέιτον/Παρισίων και να συμβάλει σε ένα Ασφαλές και Προστατευμένο Περιβάλλον (SASE) στη Βοσνία-Ερζεγοβίνη.
Η Διακήρυξη της Θεσσαλονίκης του 2003 επιβεβαίωσε ότι το μέλλον των Δυτικών Βαλκανίων, των οποίων η Βοσνία-Ερζεγοβίνη αποτελεί κεντρικό και σημαντικό τμήμα, βρίσκεται εντός της ΕΕ. Η επιχείρηση ALTHEA αποτελεί μια πτυχή της συνολικής και συνεκτικής δέσμευσης της ΕΕ προς τη Βοσνία-Ερζεγοβίνη. Προσθέτει μια επιπλέον διάσταση στην υφιστάμενη πολιτική δέσμευση, τα προγράμματα βοήθειας και τις αστυνομικές αποστολές και αποστολές παρακολούθησης που βρίσκονται ήδη σε εξέλιξη. Η ALTHEA είναι η τρίτη και μεγαλύτερη στρατιωτική επιχείρηση που έχει ξεκινήσει η ΕΕ μέχρι σήμερα.
Η Αποστολή επικεντρώνεται στη διατήρηση ενός Ασφαλούς και Προστατευμένου Περιβάλλοντος (SASE) εντός της Βοσνίας-Ερζεγοβίνης, συνεργαζόμενη πλήρως με τις Ένοπλες Δυνάμεις, τις Υπηρεσίες Επιβολής του Νόμου και τις Πολιτικές Αρχές της χώρας. Η EUFOR υποστηρίζει τις Ένοπλες Δυνάμεις της Βοσνίας-Ερζεγοβίνης (AF BiH) με τακτικές συνδυασμένες εκπαιδευτικές σειρές και ετήσιες ασκήσεις μεγάλης κλίμακας για την επίτευξη των στόχων της αποστολής.
Έπειτα από διάφορες διαδικασίες αναδιάρθρωσης, τα στρατεύματα της EUFOR μειώθηκαν σε περίπου 600 και η Δύναμη επικεντρώνεται τώρα κυρίως σε συλλογική και συνδυασμένη εκπαίδευση μαζί με τις Ένοπλες Δυνάμεις της Βοσνίας-Ερζεγοβίνης (AF BiH).
Η EUFOR διαθέτει ένα Πολυεθνικό Τάγμα που της επιτρέπει να ανταποκρίνεται ανάλογα με τις ανάγκες για να υποστήριξη τις αρχές της Βοσνίας-Ερζεγοβίνης στη διατήρηση της ενός Ασφαλούς και Προστατευμένου Περιβάλλοντος (SASE). Ποτέ δεν χρειάστηκε να ενεργήσει υπό αυτή την ιδιότητα. Η EUFOR έχει μικρό αποτύπωμα από άποψη προσωπικού, αλλά έχει τη δυνατότητα να επιστρατεύει γρήγορα εφεδρικές δυνάμεις από όλη την Ευρώπη για να συμπληρώσει τις δυνατότητές της.